Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrxO55103 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PrxO55103 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrxO55103 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrxO55103 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrxO55103 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrxO55103 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrxO55103 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrxO55103 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrxO55103 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrxO55103 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrxO55103 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrxO55103 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PrxO55103 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrxO55103 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrxO55103 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrxO55103 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrxO55103 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrxO55103 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrxO55103 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrxO55103 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrxO55103 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PrxO55103 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrxO55103 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrxO55103 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrxO55103 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrxO55103 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrxO55103 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrxO55103 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrxO55103 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrxO55103 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrxO55103 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrxO55103 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrxO55103 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrxO55103 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrxO55103 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrxO55103 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PrxO55103 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrxO55103 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PrxO55103 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PrxO55103 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrxO55103 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrxO55103 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrxO55103 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrxO55103 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrxO55103 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrxO55103 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrxO55103 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrxO55103 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrxO55103 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrxO55103 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PrxO55103 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrxO55103 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrxO55103 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrxO55103 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrxO55103 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrxO55103 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrxO55103 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PrxO55103 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms