Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LatO54957 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LatO54957 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LatO54957 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LatO54957 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LatO54957 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LatO54957 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LatO54957 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LatO54957 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LatO54957 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LatO54957 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LatO54957 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LatO54957 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LatO54957 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LatO54957 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LatO54957 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LatO54957 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LatO54957 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LatO54957 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LatO54957 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LatO54957 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LatO54957 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LatO54957 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LatO54957 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LatO54957 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LatO54957 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LatO54957 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LatO54957 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LatO54957 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LatO54957 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LatO54957 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LatO54957 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms