Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp10aO54827 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp10aO54827 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms