Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pold2O35654 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold2O35654 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold2O35654 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pold2O35654 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms