Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ppef2O35385 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms