Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn1O35350 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn1O35350 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn1O35350 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Capn1O35350 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Capn1O35350 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms