Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f3O35261 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2f3O35261 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2f3O35261 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2f3O35261 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms