Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pitx3O35160 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pitx3O35160 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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