Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Polr1aO35134 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms