Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ArxO35085 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ArxO35085 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArxO35085 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArxO35085 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArxO35085 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArxO35085 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArxO35085 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArxO35085 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArxO35085 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArxO35085 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ArxO35085 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArxO35085 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArxO35085 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArxO35085 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArxO35085 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ArxO35085 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArxO35085 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArxO35085 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArxO35085 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArxO35085 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArxO35085 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArxO35085 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ArxO35085 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ArxO35085 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ArxO35085 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ArxO35085 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ArxO35085 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ArxO35085 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArxO35085 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ArxO35085 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArxO35085 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArxO35085 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ArxO35085 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArxO35085 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArxO35085 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArxO35085 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArxO35085 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArxO35085 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ArxO35085 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArxO35085 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArxO35085 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArxO35085 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArxO35085 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArxO35085 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArxO35085 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArxO35085 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArxO35085 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArxO35085 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArxO35085 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArxO35085 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ArxO35085 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ArxO35085 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArxO35085 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArxO35085 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArxO35085 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArxO35085 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ArxO35085 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArxO35085 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArxO35085 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArxO35085 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ArxO35085 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ArxO35085 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms