Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sypl1O09117 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sypl1O09117 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms