Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ascl4M0QW46 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms