Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8888J3QPX5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8888J3QPX5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms