Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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