Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm8356J3QPD3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm8356J3QPD3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm8356J3QPD3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Gm8356J3QPD3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm8356J3QPD3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm8356J3QPD3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm8356J3QPD3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm8356J3QPD3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm8356J3QPD3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm8356J3QPD3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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