Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms