Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r12G5E8G1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r12G5E8G1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms