Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms