Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SprtnG3X912 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SprtnG3X912 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms