Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
D430041D05RikF6ZGR6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms