Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc74aE9Q9U8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms