Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc141E9Q8Q6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc141E9Q8Q6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms