Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp31E9Q6Y8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp31E9Q6Y8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms