Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DspE9Q557 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DspE9Q557 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DspE9Q557 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms