Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trip11E9Q512 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trip11E9Q512 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms