Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Susd1E9Q3H4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Susd1E9Q3H4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms