Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NebE9Q1W3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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