Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gm3893E9Q1I1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Gm3893E9Q1I1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Gm3893E9Q1I1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Gm3893E9Q1I1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Gm3893E9Q1I1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Gm3893E9Q1I1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Gm3893E9Q1I1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Gm3893E9Q1I1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Gm3893E9Q1I1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3893E9Q1I1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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