Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r68E9Q0V3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms