Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdr1E9Q0B4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdr1E9Q0B4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms