Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chd2E9PZM4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Chd2E9PZM4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chd2E9PZM4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms