Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm5415E9PXF3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms