Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4931408C20RikE9PWP9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4931408C20RikE9PWP9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms