Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc144bE9PVZ3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc144bE9PVZ3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms