Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm9008E9PVG0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms