Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc175E9PVB3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc175E9PVB3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms