Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syde2E9PUP1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms