Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Clca3bE9PUL3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca3bE9PUL3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms