Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Soga1E1U8D0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Soga1E1U8D0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms