Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cngb1E1AZ71 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cngb1E1AZ71 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cngb1E1AZ71 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms