Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R1

Hfm1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hfm1D3Z4R1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hfm1D3Z4R1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hfm1D3Z4R1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hfm1D3Z4R1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms