Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms