Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rexo5D3YW29 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rexo5D3YW29 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms