Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cttnbp2B9EJA2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cttnbp2B9EJA2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cttnbp2B9EJA2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms