Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Clip3B9EHT4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clip3B9EHT4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms