Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11bB4XVQ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11bB4XVQ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms