Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Abcc8B2RUS7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Abcc8B2RUS7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Abcc8B2RUS7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abcc8B2RUS7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Abcc8B2RUS7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Abcc8B2RUS7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms