Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprbB2RU80 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtprbB2RU80 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms