Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf518bB2RRE4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf518bB2RRE4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms