Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mbd5B1AYB6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mbd5B1AYB6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mbd5B1AYB6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms